Sepsis
Outer membrane vesicles produced by pathogenic strains of Escherichia coli block autophagic flux and exacerbate inflammasome activation (https://doi.org/10.1080/15548627.2022.2054040)
Auteurs : Laure David, Frédéric Taieb, Marie Pénary, Pierre-Jean Bordignon, Rémi Planès, Salimata Bagayoko, Valérie Duplan-Eche, Etienne Meunier, Eric Oswald
La France s’est engagée avec force dans la lutte contre le sepsis. Le ministère des Solidarités et de la Sante, en collaboration avec les sociétés savantes et l’association de patients France Sepsis Association, mène plusieurs travaux ayant pour objectifs d’améliorer la surveillance des cas de sepsis sur le territoire, la connaissance du public sur le sepsis, la formation des professionnels de santé, la prévention, le dépistage et le traitement du sepsis.
L’équipe « Pathogénie et commensalisme des entérobactéries » de l’Institut de recherche en santé digestive (IRSD – Inserm / INRAE / ENVT / CHU / UT3 Paul Sabatier) dirigée par le Pr. Oswald mène des travaux de recherche en ce sens. Leurs résultats montrent que dans la lutte contre le sepsis, il ne faut pas seulement tuer les bactéries en cause, mais réduire aussi leur capacité à produire des vésicules de quelques dizaines de nanomètres (appelées OMV pour Outer Membrane Vesicle en anglais). Pour cela, il faut agir directement en amont sur les mécanismes de production de ces nanoparticules et/ou en développant des stratégies thérapeutiques pour les éliminer. L’équipe a en effet montré que ces OMV sont très délétères pour l’hôte, et pourraient favoriser l’aggravation du sepsis. Ces résultats ont fait l’objet d’une publication dans la revue scientifique Autophagy.
Antibiorésistance
Bornier, F., Zas, E., Potheret, D., Laaberki, M. H., Coupat-Goutaland, B., & Charpentier, X. (2021). Environmental Free-Living Amoebae Can Predate on Diverse Antibiotic-Resistant Human Pathogens. Applied and environmental microbiology, 87(18), e0074721. https://doi.org/10.1128/AEM.00747-215.
Et si le secret pour lutter contre certains pathogènes bactériens résistants aux antibiotiques se trouvait juste sous nos pieds, dans des environnements aqueux, telluriques ou simplement du compost ?
C’est à cette question peu banale que le laboratoire du Dr. Xavier Charpentier, basé au Centre International de Recherche en Infectiologie (Lyon, France), s’est intéressé dans leur étude parue dans la revue Applied and Environmental Microbiology.
Dans cet article Félix Bornier, doctorant, et ses collaborateurs ont pu démontrer que certaines amibes environnementales, isolées à partir de compost, possèdent la capacité naturelle d’éradiquer de nombreux pathogènes tels que Acinetobacter baumannii, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa ou encore Staphylococcus aureus.
De manière fascinante, certaines de ces amibes appartenant aux genres Vermamoeba, Tetramitus, Acanthamoeba, Vahlkampfia ou Stemonitis, étaient non seulement capables de se nourrir de souches conventionnelles de laboratoire, mais également d’isolats cliniques hautement virulents résistants aux carbapénèmes ou à la méticilline.
Phagothérapie et antibiorésistance
Ferry T, Kolenda C, Briot T, Lustig S, Leboucher G, Laurent F; Lyon BJI study group; Lyon Bone and Joint Study Group; PHAGEinLYON Study Group. Implementation of a complex bone and joint infection phage therapy center in France: Lessons to be learned after 4 years' experience.
Clin Microbiol Infect. 2021 Oct 4:S1198-743X(21)00556-5.
Through this letter to the editor, Infectious diseases specialists from Lyon (Inserm U1111, CNRS UMR5308, ENS de Lyon, UCBL1, Hospices Civils de Lyon) indicate that a "phage 2.0 era" is now open, and it becomes necessary to identify relevant indications and assess efficacy in these indications through clinical trials. They set out to identify the clinical settings in which phage therapy provides medical benefit. Phage therapy has a huge potential to reduce the burden of implant-associated infections and antimicrobial resistance. However, in their view, implementation needs a specific approach different from that for antibiotics. In the phage therapy 2.0 era, nation-wide academic referral centers for phage therapy need to be set up in each European country, in direct connection with the respective national healthcare authorities, with a European interactive network for phage therapy (which has yet to be created). This should promote and foster: (i) sharing of experience, (ii) discussions at the level of each European nation but also with the EMA about the regulatory status of phages; and (iii) assessment of performance in clinical trials.
Antibiorésistance
Coupri D, Verneuil N, Hartke A, Liebaut A, Lequeux T, Pfund E, Budin-Verneuil A. Inhibition of d-alanylation of teichoic acids overcomes resistance of methicillin-resistant Staphylococcus aureus.
J Antimicrob Chemother. 2021 Aug 27:dkab287.
Press
Les Staphylococcus aureus résistant à la méticilline (SARM) sont des pathogènes multirésistants classés hautement prioritaires. Bien qu'il existe encore quelques antibiotiques actifs contre le SARM, des efforts sont nécessaires pour découvrir de nouveaux antibiotiques et de nouvelles stratégies de traitement car des résistances à ces nouveaux médicaments ont déjà été signalées. Des chercheurs du CNRS, du laboratoire de Chimie Moléculaire et Thioorganique de l'Université de Normandie, ont identifié que des inhibiteurs de la d-alanylation des AT ciblant les enzymes du système Dlt devraient être des adjuvants thérapeutiques prometteurs, notamment en combinaison avec les carbapénèmes, afin de restaurer l'efficacité thérapeutique de cette classe d'antibiotiques contre le SARM.
Susceptibilité génétique
Béziat V, Rapaport F, Hu J, Titeux M, Bonnet des Claustres M, Bourgey M, Griffin H, Bandet É, Ma CS, Sherkat R, Rokni-Zadeh H, Louis DM, Changi-Ashtiani M, Delmonte OM, Fukushima T, Habib T, Guennoun A, Khan T, Bender N, Rahman M, About F, Yang R, Rao G, Rouzaud C, Li J, Shearer D, Balogh K, Al Ali F, Ata M, Dabiri S, Momenilandi M, Nammour J, Alyanakian MA, Leruez-Ville M, Guenat D, Materna M, Marcot L, Vladikine N, Soret C, Vahidnezhad H, Youssefian L, Saeidian AH, Uitto J, Catherinot É, Navabi SS, Zarhrate M, Woodley DT, Jeljeli M, Abraham T, Belkaya S, Lorenzo L, Rosain J, Bayat M, Lanternier F, Lortholary O, Zakavi F, Gros P, Orth G, Abel L, Prétet JL, Fraitag S, Jouanguy E, Davis MM, Tangye SG, Notarangelo LD, Marr N, Waterboer T, Langlais D, Doorbar J, Hovnanian A, Christensen N, Bossuyt X, Shahrooei M, Casanova JL.
Humans with inherited T cell CD28 deficiency are susceptible to skin papillomaviruses but are otherwise healthy.
Cell. 2021 July
Press
Découverte d'une première cause génétique pour le syndrome de l'homme-arbre (papillomavirus cutané)
De très rares patients dans le monde porteurs de papillomavirus humains (HPV) développent des formes sévères de ces maladies virales, dont le syndrome de « l’homme-arbre ». Cette maladie très handicapante se manifeste par une poussée anarchique de cornes cutanées pour lesquelles une chirurgie n’est pas efficace. Dans le cadre d’une collaboration internationale, des chercheurs de l’Inserm et enseignants-chercheurs d’Université de Paris et médecins de l’AP-HP regroupés à l’Institut Imagine (Inserm/Université de Paris, AP-HP) de l’hôpital Necker-Enfants malades ont mis en évidence pour la première fois une cause génétique de ce syndrome. Ce travail publié dans la revue Cell a été mené par Vivien Béziat, sous la supervision des Pr Jean-Laurent Casanova et Laurent Abel qui dirigent un laboratoire associé entre Paris et l’Université Rockefeller de New York.
Parasistologie
Amiar S, Katris NJ, Berry L, Dass S, Duley S, Arnold CS, Shears MJ, Brunet C, Touquet B, McFadden GI, Yamaryo-Botté Y, Botté CY.
Division and Adaptation to Host Environment of Apicomplexan Parasites Depend on Apicoplast Lipid Metabolic Plasticity and Host Organelle Remodeling.
Cell Rep. 2020 March
Press
Comment le parasite s'adapte à la nutrition de son hôte
Existe-t-il un lien entre notre état de santé et notre alimentation et la propagation de maladies infectieuses et chroniques dues à des agents parasitaires présents dans notre organisme ? Dans cet article paru dans la revue Cell reports, les scientifiques montrent comment des parasites intracellulaires de l’homme responsables de la toxoplasmose et du paludisme sont capables de ressentir l’état nutritionnel de leur hôte pour mettre en place un programme métabolique unique assurant leur survie. Ces travaux apportent un éclairage nouveau dans la compréhension de l’interaction métabolique entre ces pathogènes et leurs hôtes humains.
Parasitologie
Dass S, Shunmugam S, Berry L, Arnold CS, Katris NJ, Duley S, Pierrel F, Cesbron-Delauw MF, Yamaryo-Botté Y, Botté CY.
Toxoplasma LIPIN is essential in channeling host lipid fluxes through membrane biogenesis and lipid storage.
Nat Commun. 2021 May
Press
Toxoplasmose : une balance métabolique parasitaire pour gérer et épargner les ressources de l'hôte
La survie des parasites responsables de la toxoplasmose dépend du contrôle des ressources lipidiques puisées chez leur hôte. Dans cette étude, publiée dans la revue Nature Communications, les scientifiques montrent que le parasite met en place une “balance métabolique” permettant de gérer l’acquisition des lipides, leur consommation et leur stockage, évitant sa mort par surconsommation et lipotoxicité.
Microbiote intestinal
Brial F, Chilloux J, Nielsen T, Vieira-Silva S, Falony G, Andrikopoulos P, Olanipekun M, Hoyles L, Djouadi F, Neves AL, Rodriguez-Martinez A, Mouawad GI, Pons N, Forslund S, Le-Chatelier E, Le Lay A, Nicholson J, Hansen T, Hyötyläinen T, Clément K, Oresic M, Bork P, Ehrlich SD, Raes J, Pedersen OB, Gauguier D, Dumas ME.
Human and preclinical studies of the host-gut microbiome co-metabolite hippurate as a marker and mediator of metabolic health.
Gut. 2021 May.
Press
Le bon fonctionnement de notre microbiote intestinal a un impact sur notre santé générale, physique et psychologique. Comprendre comment l’architecture du microbiote et la fonction des bactéries qui l’habitent influent sur l’organisme est devenu un axe de recherche essentiel ces dernières années. Dans ce contexte, des chercheurs et chercheuses de l’Inserm et d’Université de Paris, en collaboration avec des équipes d’Inrae, de l’Imperial College à Londres et de l’université de Copenhague au Danemark ont montré qu’un métabolite issu des bactéries intestinales, l’hippurate, est associé à la diversité du microbiote. Il jouerait un rôle important pour notre santé cardiovasculaire et métabolique, notamment en participant à la régulation de la glycémie.
Microbiologie
Chagneau CV, Massip C, Bossuet-Greif N, Fremez C, Motta JP, Shima A, Besson C, Le Faouder P, Cénac N, Roth MP, Coppin H, Fontanié M, Martin P, Nougayrède JP, Oswald E.
Uropathogenic E. coli induces DNA damage in the bladder.
PLoS Pathog. 2021 Feb.
Press
Les infections urinaires touchent plus de 50 % des femmes, dans certains cas de manière récurrente. La bactérie E. coli est très souvent impliquée dans le développement de ces infections. Pour la première fois, des scientifiques de l’Inserm, du CHU de Toulouse, d’INRAE, de l’Université Toulouse III – Paul Sabatier et de l’École nationale vétérinaire de Toulouse ont identifié la présence d’une toxine produite par ces bactéries dans les urines de patientes, qui aurait pour effet d’endommager l’ADN des cellules de la vessie. Ces résultats ouvrent la voie à de nouvelles réflexions pour affiner la prise en charge des patientes sujettes à infections urinaires récurrentes et soulèvent la question du rôle des infections urinaires dans le cancer de la vessie.
Microbiote
Viennois E, Bretin A, Dubé PE, Maue AC, Dauriat CJG, Barnich N, Gewirtz AT, Chassaing B. Dietary Emulsifiers Directly Impact Adherent-Invasive E. coli Gene Expression to Drive Chronic Intestinal Inflammation.
Cell Rep. 2020 Oct.
Press
L’alimentation jouerait un rôle dans le déclenchement d’inflammations intestinales pouvant aboutir au développement de certaines pathologies, comme la maladie de Crohn. Des chercheurs de l’Inserm, du CNRS et de Université de Paris ont montré que les émulsifiants alimentaires présents dans de nombreux plats transformés pouvaient avoir un impact délétère sur certaines bactéries spécifiques du microbiote intestinal, conduisant à une inflammation chronique.